Años más tarde, el día 16 de julio de 1212 se inicia la batalla más decisiva de la Reconquista, la batalla de las Navas de Tolosa (Jaén), llamada por entonces Hisn al-Uqab. Esta vez se enfrentan todos los reinos españoles excepto León, los comandaba Alfonso VIII de Castilla junto con Sancho VIII de Navarra y Pedro II de Aragón. En esta batalla tomaron parte también, como era de esperar, las Órdenes de Calatrava, Santiago y las internacionales de los Hospitalarios y de los Templarios. Se puede decir que un gran ejército aunque en una abrumadora inferioridad numérica.

Tras una enconada, sangrienta y a veces poco clara batalla, las tropas cristianas toman el campamento de "Miramamolín", el califa Muhammad III Ibn-Yakub. Los cristianos habían ganado una gran batalla y además la posición estratégica de Navas de Tolosa que serviría de puente de lanzamiento para la toma de Andalucía, el último bastión musulman.

Los reyes, una vez más, usaron la fuerza de las Órdenes Militares para sus propósitos aunque bien se sabe que no hacía falta mucho para que éstas tomaran las armas en contra del "infiel".

La guerra fue un gran negocio para las Órdenes Militares españolas, los reyes donaban grandes extensiones de terreno a las mismas para un mejor servicio en el frente de batalla y para su repoblación. Éstas a su vez guerreaban más y mejor y la repoblación les supuso, a mayores, un fructífero negocio. Con esto no queremos dar a entender que la Reconquista fue un negocio sino que sirvió para enriquecer a organizaciones comunales que luego fue a parar a manos de algunos pocos.

Las batallas continuaron, en 1217 las Órdenes del Temple, de San Juan o del Hospital y las españolas de Calatrava y Santiago avanzan por el oeste de la Península, esto es, Portugal, los cristianos vencieron y continuaron su avance al suroeste español.

Al tiempo, los hermanos españoles avanzan por Despeñaperros y comienzan la toma de ciudades árabes como Andújar (1225), Mallorca (1229), Jerez de la Frontera (1231), Menorca (1232), Trujillo (1233), Úbeda (1234), Tarragona (1235), Córdoba (1236), Valencia (1238) y un largo etcétera.

Fernando III el Santo, a su muerte dedicó la Catedral de Sevilla (antigua mezquita) a la Virgen y quiso que su cuerpo fuera enterrado allí. Lo mismo hizo Isabel la Católica con Granada.

Sólo quedaba el reino de Granada. Su reconquista no fue terminada hasta 1492. Al-Ahmar, como así se llamaba el poderoso de Granada, pactó con Fernando III en 1246 y le ayudó a la toma de Sevilla dos años más tarde. A la muerte del caudillo árabe los nuevos califas de la familia de Banu Marin empezaron a diseñar una contraofensiva general en el sur español en el año 1279. Esta se materializó al año siguiente cuando la Orden de Santiago fue diezmada en Moclín (Granada). Los hermanos no tuvieron más remedio que unirse a otra pequeña Orden fundada por un ex-hermano, la Orden de Santa María de España. Ésta fue absorbida por la de Santiago y su maestre pasó a ser el de la Orden unificada. En el año 1312 la Orden del Temple fue abolida (traicionada por los reyes de Francia, Inglaterra, Castilla, León, Aragón, y Portugal), se creó sobre sus cenizas la Orden de Montesa oficialmente el 10 de junio de 1317, en Valencia.