A partir de 1234 la corona gala reina sobre Navarra por decisión de los navarros que veían a Castilla como  un peligro mayor, gran error pues mantuvieron los fueros (es decir, la prerrogativa de proponer y controlar las leyes que se ejecutaban en la región), pasan por esta corona los linajes de Champaña (1234-1274), los Capetos (1274-1328) y los Evreux (1328-1425).

De esta última casa era Carlos III el Noble (1361-1425), quién provocó una guerra civil (en Navarra) al morir sin descendencia. Los que optan a la corona son Juan II por los agramonteses al estar casado con Blanca de Navarra (heredera al trono) y Carlos el Príncipe de Viana por los beaumonteses que además era su hijastro. Esta guerra civil que druó 50 años se saldó con la invasión por parte de Castilla de las tierras navarras aprovechando su alianza con los seguidores del Príncipe de VIana (1512). A partir de aquí Navarra pertenece a Castilla siendo gobernada por la Corona castellana pues en el año 1512 el Duque de Alba toma Navarra aunque mantiene sus fueros propios.

La baja Navarra también tuvo su propia monarquía, la casa de Foix-Albret, esta corona perteneció a Francia desde el siglo XVII hasta el año 1789.

La paz vuelve a estas tierras pero por muy poco tiempo, en 1833 estalla la Primera Guerra Carlista debido a la política estatal de la monarquía borbónica. En 1839 los carlistas pactan la paz. De este conflicto saldrá la llamada "Ley Paccionada" de 1841 que considera a Navarra una provincia más de España respetando la tradición de la instituciones forales.

Tras la Guerra Civil española le tocó, como al resto de España, empezar desde cero y reconstruir lo destruído manteniendo sus privilegios. Es en el siglo XX cuando Pamplona y por tanto Navarra se hicieron famosos universalmente por sus famosos encierros de San Fermín, divulgados en sus obras literarias por Ernest Hemingway.